Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700024B05RikE9Q6D7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700024B05RikE9Q6D7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms