Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-1B6SEH8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms