Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L3A6NCW0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L3A6NCW0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms