Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRGMA1A4Y4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms