Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 DNAJB8-202ENST00000469083 3365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 WDR78-202ENST00000371023 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SEC14L2-201ENST00000402592 1229 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 NCR1-205ENST00000594765 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRXP46100 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRXP46100 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC01515-201ENST00000433152 1339 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC005037.1-202ENST00000332935 820 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC106774.3-201ENST00000505444 169 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC010551.1-201ENST00000568458 469 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BMF-203ENST00000431415 492 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 POLR2H-205ENST00000443489 807 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC008993.1-201ENST00000632280 776 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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