Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 NOMO2-210ENST00000620440 1360 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 LINC01515-201ENST00000433152 1339 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AL445989.1-201ENST00000611641 1436 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 FAM238A-201ENST00000412114 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 GPAA1P1-201ENST00000453019 931 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 ACRBP-204ENST00000536350 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 ZCRB1-205ENST00000552673 907 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 TBC1D21-203ENST00000562056 965 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AC026464.4-201ENST00000570054 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 IPO7-208ENST00000630083 195 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AL589826.2-201ENST00000635423 993 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 ARSG-202ENST00000452479 1733 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 AL627309.3-201ENST00000495576 1319 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NESP48681 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 KIR2DL4-201ENST00000345540 1447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 MLN-201ENST00000266003 527 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AL451165.1-201ENST00000334441 328 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 ADH5P2-201ENST00000425922 1124 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AP005018.2-201ENST00000528464 822 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AC011471.2-201ENST00000588192 523 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 SHANK2-AS3-201ENST00000307548 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AC020629.1-201ENST00000550858 1650 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NESP48681 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 HLA-DRA-202ENST00000395388 1280 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 DICER1-AS1-201ENST00000435343 723 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 AC023347.1-201ENST00000435352 604 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 ITIH4-AS1-201ENST00000478366 395 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 GSKIP-203ENST00000554182 760 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 RN7SL784P-201ENST00000577319 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 AC005746.1-202ENST00000585495 716 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 TMEM136-201ENST00000314475 1434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 NIF3L1-201ENST00000359683 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 SGK494-201ENST00000301037 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 GAGE12H-201ENST00000381722 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NESP48681 AP001630.1-201ENST00000428410 437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms