Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP17Q9ULZ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms