Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA1Q9UJY5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 676.4 ms