Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLXNA1Q9UIW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms