Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED13Q9UHV7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13Q9UHV7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms