Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MBD5Q9P267 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MBD5Q9P267 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
MBD5Q9P267 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MBD5Q9P267 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MBD5Q9P267 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
MBD5Q9P267 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MBD5Q9P267 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MBD5Q9P267 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MBD5Q9P267 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MBD5Q9P267 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.77■■■■□ 3
MBD5Q9P267 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.77■■■■□ 3
MBD5Q9P267 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MBD5Q9P267 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MBD5Q9P267 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms