Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD3Q9NYL9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD3Q9NYL9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms