Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3GQ9NS98 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms