Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K8

Slc25a39, Solute carrier family 25 member 39, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a39Q9D8K8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc25a39Q9D8K8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a39Q9D8K8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms