Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EDEM3Q9BZQ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms