Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIKE1Q9BRV8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIKE1Q9BRV8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms