Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOPXQ9BPY8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOPXQ9BPY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms