Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD5Q99666 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RGPD5Q99666 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD5Q99666 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms