Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELF4Q99607 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms