Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGS1Q96RS0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGS1Q96RS0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGS1Q96RS0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms