Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED3Q96IU2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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