Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM17Q96I25 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBM17Q96I25 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM17Q96I25 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM17Q96I25 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM17Q96I25 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM17Q96I25 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM17Q96I25 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM17Q96I25 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM17Q96I25 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM17Q96I25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM17Q96I25 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM17Q96I25 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM17Q96I25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM17Q96I25 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM17Q96I25 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM17Q96I25 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM17Q96I25 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM17Q96I25 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms