Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PANK1Q8TE04 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PANK1Q8TE04 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PANK1Q8TE04 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms