Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms