Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScocQ78YZ6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ScocQ78YZ6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms