Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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