Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lamb3Q61087 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamb3Q61087 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms