Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARMIL1Q5VZK9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms