Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM196Q5HYL7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms