Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUSP28Q4G0W2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms