Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms