Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30BQ3MIR4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms