Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NKX1-1Q15270 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NKX1-1Q15270 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms