Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CDK13Q14004 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
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