Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP140Q13342 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP140Q13342 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SP140Q13342 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SP140Q13342 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP140Q13342 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP140Q13342 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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