Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 YCL075WYCL075W 441 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 HGH1YGR187C 1185 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 MNN11YJL183W 1269 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 CDC8YJR057W 651 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 AKR1YDR264C 2295 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 POL3YDL102W 3294 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 PRP19YLL036C 1512 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 DER1YBR201W 636 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 APC1YNL172W 5247 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 VMS1YDR049W 1899 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 VAC8YEL013W 1737 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 snR32snR32 188 nt5.37□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 DIP2YLR129W 2832 nt5.36□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 ECM21YBL101C 3354 nt5.36□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 YHR180WYHR180W 492 nt5.36□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 RNH203YLR154C 333 nt5.36□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 VTA1YLR181C 993 nt5.36□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 SRB6YBR253W 366 nt5.36□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 BNA5YLR231C 1362 nt5.35□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 MSR1YHR091C 1932 nt5.35□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 YGR107WYGR107W 450 nt5.34□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 CDS1YBR029C 1374 nt5.34□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 TAF8YML114C 1533 nt5.34□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 DAM1YGR113W 1032 nt5.34□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 ARC15YIL062C 465 nt5.34□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 USB1YLR132C 873 nt5.34□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 RIM11YMR139W 1113 nt5.34□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 ATG8YBL078C 354 nt5.34□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 HSP82YPL240C 2130 nt5.33□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 BMH1YER177W 804 nt5.33□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 PRE9YGR135W 777 nt5.33□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt5.33□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 RIM9YMR063W 720 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 PSF3YOL146W 585 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 FAS2YPL231W 5664 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 BOI2YER114C 3123 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 YGR051CYGR051C 324 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 MBB1YJL199C 327 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 YBL059WYBL059W 582 nt5.32□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 COX23YHR116W 456 nt5.31□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 SHE1YBL031W 1017 nt5.31□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 FSH3YOR280C 801 nt5.31□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 YDR444WYDR444W 2064 nt5.3□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 TRM1YDR120C 1713 nt5.3□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 CHD1YER164W 4407 nt5.29□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 YBR137WYBR137W 540 nt5.29□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 RIM15YFL033C 5313 nt5.28□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 RPL8AYHL033C 771 nt5.28□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 PPX1YHR201C 1194 nt5.28□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 EKI1YDR147W 1605 nt5.28□□□□□ -1.56
TY2B-BQ12491 ECM16YMR128W 3804 nt5.27□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 APC9YLR102C 798 nt5.27□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 DRS2YAL026C 4068 nt5.27□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 EMP70YLR083C 2004 nt5.27□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 YPL114WYPL114W 420 nt5.27□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 STP22YCL008C 1158 nt5.27□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 SAS10YDL153C 1833 nt5.26□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 YTA6YPL074W 2265 nt5.26□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 AVT1YJR001W 1809 nt5.26□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 HOM3YER052C 1584 nt5.26□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 MET10YFR030W 3108 nt5.25□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 PEX7YDR142C 1128 nt5.25□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 YER034WYER034W 558 nt5.25□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 RAD53YPL153C 2466 nt5.25□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 YML020WYML020W 1995 nt5.25□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 PAM1YDR251W 2493 nt5.24□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 UBA2YDR390C 1911 nt5.24□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 TOS3YGL179C 1683 nt5.24□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 TED1YIL039W 1422 nt5.24□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 YJR128WYJR128W 360 nt5.24□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 MIS1YBR084W 2928 nt5.24□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 EXO5YBR163W 1758 nt5.23□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 HOM2YDR158W 1098 nt5.23□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.23□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.23□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 MCK1YNL307C 1128 nt5.23□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 NOP7YGR103W 1818 nt5.22□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 COS8YHL048W 1146 nt5.22□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 CKA2YOR061W 1020 nt5.22□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 NIP7YPL211W 546 nt5.22□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 MRH1YDR033W 963 nt5.21□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 COA4YLR218C 453 nt5.21□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 SUE1YPR151C 621 nt5.21□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 RPS9BYBR189W 588 nt5.21□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 IME4YGL192W 1803 nt5.21□□□□□ -1.57
TY2B-BQ12491 LEU1YGL009C 2340 nt5.21□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 YFL052WYFL052W 1398 nt5.21□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 HSP42YDR171W 1128 nt5.21□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 YJL175WYJL175W 513 nt5.21□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 MAK16YAL025C 921 nt5.21□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 TEM1YML064C 738 nt5.21□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 RAI1YGL246C 1164 nt5.2□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 MRPL16YBL038W 699 nt5.2□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 PAP1YKR002W 1707 nt5.19□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 RTT109YLL002W 1311 nt5.19□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 OMS1YDR316W 1416 nt5.19□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 PHM8YER037W 966 nt5.19□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.19□□□□□ -1.58
TY2B-BQ12491 ECM32YER176W 3366 nt5.18□□□□□ -1.58
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