Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms