Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP2Q03169 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms