Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 VAC8YEL013W 1737 nt5.14□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YTA6YPL074W 2265 nt5.14□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YHR180WYHR180W 492 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 PDR16YNL231C 1056 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 ADE6YGR061C 4077 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 DIP2YLR129W 2832 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YDR444WYDR444W 2064 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.13□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YCL075WYCL075W 441 nt5.12□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 UBX5YDR330W 1503 nt5.12□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 THI7YLR237W 1797 nt5.12□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 YTM1YOR272W 1383 nt5.12□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 FSH3YOR280C 801 nt5.12□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 MRPL51YPR100W 423 nt5.11□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 KIC1YHR102W 3243 nt5.1□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 APE1YKL103C 1545 nt5.1□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 HOM2YDR158W 1098 nt5.1□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 PFA4YOL003C 1137 nt5.1□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 DAM1YGR113W 1032 nt5.09□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 REC104YHR157W 549 nt5.09□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 VTA1YLR181C 993 nt5.09□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 DER1YBR201W 636 nt5.09□□□□□ -1.59
PDR12Q02785 APE2YKL157W 2859 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YER034WYER034W 558 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 ERJ5YFR041C 888 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 RPL8AYHL033C 771 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YJL218WYJL218W 591 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 MDM1YML104C 3384 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YNR063WYNR063W 1824 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YDR306CYDR306C 1437 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 UBA2YDR390C 1911 nt5.08□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 PEX7YDR142C 1128 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YGR107WYGR107W 450 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YPL114WYPL114W 420 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 SUE1YPR151C 621 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 STP22YCL008C 1158 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 PAM1YDR251W 2493 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 PAP1YKR002W 1707 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 NRM1YNR009W 750 nt5.07□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 TRM1YDR120C 1713 nt5.06□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 COX23YHR116W 456 nt5.06□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt5.06□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt5.06□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 RPL15AYLR029C 615 nt5.06□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 SLI1YGR212W 1407 nt5.06□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 MSR1YHR091C 1932 nt5.05□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 PSF3YOL146W 585 nt5.05□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 YEL057CYEL057C 702 nt5.04□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 MIS1YBR084W 2928 nt5.04□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 ARG5,6YER069W 2592 nt5.04□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 BMH1YER177W 804 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 HGH1YGR187C 1185 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 APC9YLR102C 798 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 VMS1YDR049W 1899 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR12Q02785 RPL34AYER056C-A 366 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 BOI2YER114C 3123 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 ECM21YBL101C 3354 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 IML2YJL082W 2196 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 EKI1YDR147W 1605 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 MDR1YGR100W 2853 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 YGL218WYGL218W 651 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 ARC15YIL062C 465 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 LEU1YGL009C 2340 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 SYT1YPR095C 3681 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 VBA2YBR293W 1425 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 YGR125WYGR125W 3111 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 FAS2YPL231W 5664 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 IME4YGL192W 1803 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 GRX4YER174C 735 nt5□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 CDC26YFR036W 375 nt5□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 COA4YLR218C 453 nt5□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 CDS1YBR029C 1374 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 HSP42YDR171W 1128 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 NKP1YDR383C 717 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 USB1YLR132C 873 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 RIM11YMR139W 1113 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 MCK1YNL307C 1128 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 EXO5YBR163W 1758 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 HOM3YER052C 1584 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 TAF8YML114C 1533 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 TOS3YGL179C 1683 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 YGL108CYGL108C 423 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 RIM9YMR063W 720 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 YBR137WYBR137W 540 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 AVT1YJR001W 1809 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 VID28YIL017C 2766 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 CKA2YOR061W 1020 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 ECM32YER176W 3366 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 MET10YFR030W 3108 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 ECM16YMR128W 3804 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 YND1YER005W 1893 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 SRO7YPR032W 3102 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 RPS9BYBR189W 588 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR12Q02785 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.96□□□□□ -1.62
PDR12Q02785 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms