Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 RRP36YOR287C 903 nt5.53□□□□□ -1.52
CTF4Q01454 snR37snR37 386 nt5.53□□□□□ -1.52
CTF4Q01454 MED8YBR193C 672 nt5.53□□□□□ -1.52
CTF4Q01454 YLR108CYLR108C 1458 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YDR042CYDR042C 603 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 COQ4YDR204W 1008 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 SCL1YGL011C 759 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MRPL49YJL096W 486 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 FIP1YJR093C 984 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 CNB1YKL190W 528 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 URA5YML106W 681 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 SRT1YMR101C 1032 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YMR178WYMR178W 825 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MRPS17YMR188C 714 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 PHM7YOL084W 2976 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 CBP1YJL209W 1965 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 PDR15YDR406W 4590 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MET3YJR010W 1536 nt5.52□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 STP4YDL048C 1473 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RGT1YKL038W 3513 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 CNL1YDR357C 369 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 FYV6YNL133C 522 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YOL106WYOL106W 354 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RMI1YPL024W 726 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 SET6YPL165C 1122 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YBR139WYBR139W 1527 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 NSA1YGL111W 1392 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 FAA3YIL009W 2085 nt5.51□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 TFC7YOR110W 1308 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 GCR1YPL075W 2358 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 PMT5YDL093W 2232 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RRG1YDR065W 1098 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 AUA1YFL010W-A 285 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RNA15YGL044C 891 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 PAN5YHR063C 1140 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RFU1YLR073C 603 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RUF20RUF20 443 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YBL062WYBL062W 381 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 AAH1YNL141W 1044 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 BUD17YNR027W 954 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MET16YPR167C 786 nt5.5□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 ABD1YBR236C 1311 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 HIS4YCL030C 2400 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 HTB1YDR224C 396 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 HNT2YDR305C 654 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 AAD6YFL056C 639 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RPS4BYHR203C 786 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RPS4AYJR145C 786 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RRT1YBL048W 312 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 GRX5YPL059W 453 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 SUI3YPL237W 858 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 TEC1YBR083W 1461 nt5.49□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 ESF1YDR365C 1887 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YDR133CYDR133C 336 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 PEF1YGR058W 1008 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 ARD1YHR013C 717 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 ALB1YJL122W 528 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 LSO1YJR005C-A 282 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MMM1YLL006W 1281 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YLR379WYLR379W 375 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MDM12YOL009C 816 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MDY2YOL111C 639 nt5.48□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 LDB17YDL146W 1476 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 BSC5YNR069C 1470 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YFL068WYFL068W 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 CLC1YGR167W 702 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 IST3YIR005W 447 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 RSM26YJR101W 801 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 TFA2YKR062W 987 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 SEC72YLR292C 582 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 ROT1YMR200W 771 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YOR097CYOR097C 528 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 snR17bsnR17b 332 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.47□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 MCM2YBL023C 2607 nt5.46□□□□□ -1.53
CTF4Q01454 CBS2YDR197W 1170 nt5.46□□□□□ -1.54
CTF4Q01454 UBC8YEL012W 657 nt5.46□□□□□ -1.54
CTF4Q01454 SPO11YHL022C 1197 nt5.46□□□□□ -1.54
CTF4Q01454 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt5.46□□□□□ -1.54
CTF4Q01454 IRC9YJL142C 393 nt5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms