Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited1P97769 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cited1P97769 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cited1P97769 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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