Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ErfP70459 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ErfP70459 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ErfP70459 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ErfP70459 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ErfP70459 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErfP70459 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErfP70459 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErfP70459 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErfP70459 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErfP70459 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErfP70459 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErfP70459 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErfP70459 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms