Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOBP62745 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHOBP62745 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms