Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms