Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF140P52738 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms