Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP153P49790 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP153P49790 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP153P49790 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP153P49790 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP153P49790 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP153P49790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP153P49790 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP153P49790 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NUP153P49790 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NUP153P49790 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP153P49790 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP153P49790 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP153P49790 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP153P49790 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP153P49790 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP153P49790 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP153P49790 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP153P49790 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP153P49790 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP153P49790 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP153P49790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP153P49790 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP153P49790 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP153P49790 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP153P49790 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP153P49790 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP153P49790 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP153P49790 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP153P49790 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP153P49790 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NUP153P49790 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP153P49790 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP153P49790 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP153P49790 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP153P49790 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP153P49790 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP153P49790 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP153P49790 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP153P49790 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP153P49790 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP153P49790 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP153P49790 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP153P49790 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP153P49790 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP153P49790 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP153P49790 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP153P49790 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP153P49790 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NUP153P49790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NUP153P49790 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms