Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms