Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E2P29084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms