Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2B4P23634 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B4P23634 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms