Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAMP11215 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms